OEF Génétique des populations --- Introduction ---

Ce module regroupe pour l'instant 29 exercices sur la Génétique des Populations.

Autogamie

Dans une population naturelle de plantes hermaphrodites, on s'intéresse au locus biallélique . L'analyse d'un très gand échantillon a permis d'estimer les fréquence génotypiques suivantes:

Sachant que pour chaque plante % des fécondations se fait en autogamie, quelles seront les fréquences attendues des différents génotypes dans la descendance des plantes de chaque génotype ?

Génotypes descendants plante mere
Pour des calculs intermédiaires, les réponses sont attendues sans arrondi.
Génotypes descendants plante mere

Indiquez maintenant les fréquences attendues à partir de l'ensemble de la population :

GénotypesFréquences

Les réponses sont attendues avec un arrondi au millième. Vous devez arrondir chaque nombre individuellement même si la somme globale est légèrement différente de 1.


Hardy Weinberg 1

Dans une population, on observe pour un gène les effectifs génotypiques suivants sur individus échantillonnés :

Génotypes
Effectifs Observés
Effectifs Attendus

La fréquence estimée de l'allèle est .

Les réponses sont attendues avec une précision d'un dixième.

Hardy Weinberg freq

Dans une population, on observe pour un gène les effectifs génotypiques suivants sur individus échantillonnés :

Génotypes
Effectifs Observés
Fréquences observées
Fréquences Attendues
La population est-elle selon vous à l'équilibre de Hardy-Weinberg ?
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième.

Test de conformité à Hardy Weinberg

Dans une population, on observe pour un gène les effectifs génotypiques suivants sur individus échantillonnés :

Génotypes
Effectifs Observés
Effectifs Attendus

La fréquence de l'allèle a été estimée à .

On cherche à tester si la population est aux proportions de Hardy-Weinberg.

Les réponses sont attendue avec une précision d'un dixième.

Homozygotie et consanguinité

Calculez la probabilité que cet individu soit malade : En quelles proportion cette probabilité est-elle plus élevée que pour un individu pris au hasard dans la population ?
Les réponses sont attendues avec un arrondi au centième.

Migration

On s'intéresse à deux populations naturelles partiellement isolées. Ainsi la population I est constituée à chaque génération d'une proportion d'individus issus de la population II, le reste des individus étant issu de la reproduction de la population I. De même, à chaque génération une proportion d'individus de la population II provient de la population I.

A la génération n, les fréquences alléliques ont été déterminées pour un locus autosomal et pour chacune des 2 populations :

Population - Allèle
Fréquence population I
Fréquence population II

Quelles seront les fréquences de l'allèle à la génération suivante dans chacune des 2 populations ?

Population IPopulation II
Les réponses sont attendues avec un arrondi au centième.

Migration et écart de fréquences alléliques

On s'intéresse à deux populations naturelles partiellement isolées. Ainsi la population I est constituée à chaque génération d'une proportion d'individus issus de la population II, le reste des individus étant issu de la reproduction de la population I. De même, à chaque génération une proportion d'individus de la population II provient de la population I.

A la génération 0, les fréquences alléliques ont été déterminées pour un locus autosomal et pour chacune des 2 populations :

Population - Allèle
Fréquence population I
Fréquence population II

Calculez l'écart de fréquence allélique entre les deux populations :

Ecart initial entre les fréquences alléiques :

Quel sera l'écart de fréquence allélique au bout de générations ?
Les réponses sont attendues avec un arrondi au millième.

Panmixie

Une population de est constituée à partir d'individus collectés dans des localités éloignées. Les fréquence génotypiques dans cette population artificielle pour un locus biallélique sont les suivantes:

On laisse cette population se reproduire en panmixie. Quelles seront les fréquences des différents génotypes à la génération suivante ?

Quelle sera la fréquence de l'allèle à la génération suivante ?

Après une génération supplémentaire :

Les réponses sont attendues avec un arrondi au millième. Vous devez arrondir chaque nombre individuellement même si la somme globale est légèrement différente de 1.

Allèle à génotype

Dans une population naturelle, on s'intéresse à un locus biallélique présentant les allèles et . A partir des fréquences génotypiques observées, on a pu déduire la fréquence allélique de : . Sachant que , déduisez-en quelles étaient les fréquences génotypiques observées.

Fréquences génotypiques
Génotypes
Fréquences
Les réponses nécessitant un arrondi sont attendues avec une précision d'un centième.

Fréquences

Dans une grande population, types d'individus sont observés : , . A ce locus, deux allèles ont été détectés : et . . Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants.
effectifs phénotypiques

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle sans faire d'hypothèse.


Calcul de fréquences

Dans une grande population, types d'individus sont observés : , . A ce locus, deux allèles ont été détectés : et .

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants :

effectifs phénotypiques

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle sans faire d'hypothèse.

Quelle hypothèse devez vous faire pour estimer les fréquences alléliques ?
Calculez la fréquence de l'allèle :
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième

Fréquences cas réels

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants.

effectifs phénotypiques

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle sans faire d'hypothèse.

Quelle hypothèse devez vous faire pour estimer les fréquences alléliques ?
Calculez la fréquence de l'allèle :
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième.

Fréquences cas réels 2 allèles codominants

On cherche la fréquence de l'allèle

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants.

effectifs phénotypiques
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième.

Fréquences 3 allèles ou plus

Dans une population, on observe pour un gène les effectifs génotypiques suivants.

Génotypes
Effectifs
Combien de fréquences alléliques devez vous calculer ?

Le nombre de fréquences à calculer est . Calculez ces fréquences et indiquez les dans le tableau ci-dessous :

Les fréquences sont attendues avec une précision d'un centième

Coefficient de consanguinité 1


Coefficient de consanguinité 2


Coefficient de consanguinité 3

.

Coefficient de consanguinité 4


Coefficient de consanguinité 5


Coefficient de consanguinité 6


Coefficient de consanguinité


Couples

Dans une population naturelle on s'intéresse à la formation des couples. On a échantillonné couples et regardé le génotype de chacun des deux partenaires au locus . Les effectifs observés pour les différentes associations sont les suivants :

CouplesEffectifs
Calculez les fréquences génotypiques dans cette population
GénotypesFréquences
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième
Génotype
Fréquence
Les couples se forment-ils au hasard dans la population ?

Sous cette hypothèse, chacun des partenaires du couple est choisi au hasard parmi les génotypes possibles.

Couple Effectifs observés Effectifs attendus en panmixie
Quel régime de reproduction pourrait expliquer les effectifs observés ?

Formation aléatoire des couples : test

Dans une population naturelle on s'intéresse à la formation des couples. On a échantillonné couples et regardé le génotype de chacun des deux partenaires au locus . Les effectifs observés pour les différentes associations sont les suivants :

CouplesEffectifs
CouplesEffectifs observésEffectifs attendus en panmixie
Calculez les fréquences génotypiques dans cette population
GénotypesFréquences

Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième

Génotype
Fréquence

Calculez les effectifs attendus si les couples se forment au hasard et indiquez-les dans le tableau ci dessus.

Sous cette hypothèse, chacun des partenaires du couple est choisi au hasard parmi les génotypes possibles.

Les réponses sont attendues avec une précision d'un dixième

Couple Effectifs observés Effectifs attendus en panmixie
Quelle est la valeur du Chi2 ?
La réponse est attendue avec une précision d'un dixième.
La probabilité associée à cette valeur de Chi2 est-elle ?
Qu'en concluez-vous ?

Descendance

Dans une grande population de plantes à sexes séparés, on a observé un locus ayant deux allèles et . L'allèle a une fréquence de . On suppose que la reproduction se fait de façon panmictique dans cette population.

On s'intéresse aux individus issus .

Indiquez dans le tableau suivant les fréquences alléliques des gamètes impliquées dans ce croisement :
Gamètes femelles Gamètes mâles
>
Gamètes femelles Gamètes mâles
Calculez les fréquences des génotypes dans la descendance :
Les réponses nécessitant un arrondi sont attendues avec une précision d'un centième.

Gène lié au sexe

Dans une population, on s'intéresse à un gène lié au sexe. A ce locus, deux allèles sont détectés : et . .

On observe les effectifs phénotypiques suivant :

Mâles Femelles
[] []
Sans faire d'hypothèse, à partir de quel sexe pouvez vous calculer les fréquences allélique ?
Calculez la fréquence de l'allèle à partir des fréquences génotypiques des mâles
Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième.
Les fréquences alléliques sont-elles identiques chez les femelles ?

Phénotypes

Dans une grande population, types d'individus sont observés : . A ce locus, deux allèles ont été détectés : et . . Associez les phénotypes et les génotypes correspondants :
:
:
:

Phénotypes cas réels

Associez les phénotypes et les génotypes correspondants :
:
:
:

Sélection

On s'intéresse à une population naturelle qui se reproduit par panmixie. Une étude de la survie et de la reproduction a montré que la valeur sélective des individus différait selon leur génotype au locus biallélique . L'analyse d'un très gand échantillon a permis d'estimer les fréquence génotypiques et le valeurs sélectives suivantes :

Génotypes
Fréquences génotypiques
Valeurs sélectives

A partir de ces informations, calculez les fréquences génotypiques attendues à la génération suivante :

Les réponses sont attendues avec un arrondi au centième.

Sélection équilibre

On s'intéresse à une population naturelle qui se reproduit par panmixie. Une étude de la survie et de la reproduction a montré que la valeur sélective des individus différait selon leur génotype au locus biallélique . L'analyse d'un très gand échantillon a permis d'estimer les fréquence génotypiques et le valeurs sélectives suivantes :
Génotypes
Fréquences génotypiques
Valeurs sélectives
Les réponses sont attendues avec un arrondi au centième.


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